В соответствии с законом Белгородской области «Об установлении границ муниципальных образований и наделении их статусом городского, сельского поселения, городского округа, муниципального района» в муниципальном районе «Прохоровский район» образованы 1 городское и 17 сельских поселений, на территории которых находится 135 населенных пунктов:
Городское поселение «Поселок Прохоровка»;
Беленихинское сельское поселение;
Береговское сельское поселение;
Вязовское сельское поселение;
Журавское сельское поселение;
Коломыцевское сельское поселение;
Кривошеевское сельское поселение;
Лучковское сельское поселение;
Маломаяченское сельское поселение;
Петровское сельское поселение;
Плотавское сельское поселение;
Подолешенское сельское поселение;
Прелестненское сельское поселение;
Призначенское сельское поселение;
Радьковское сельское поселение;
Ржавецкое сельское поселение;
Холоднянское сельское поселение;
Шаховское сельское поселение;
Численность населения района на 1 января 2021 года составила 27163 человек.
Административным центром района является поселок городского типа Прохоровка, основанный в 1868 году как железнодорожная станция в связи с прохождением здесь Курско – Харьковско - Азовской железной дороги. До 1968 года он именовался «Александровский» в честь царя Александра II. Затем станция была переименована в честь инженера-железнодорожника Прохорова, строившего железную дорогу на линии Белгород — Курск.
Приоритетными направлениями развития района являются сельское хозяйство, перерабатывающая промышленность, туристическая деятельность.